教育
- 卒業生: 博士号, 2017, ワシントン大学
- 学部: BS, 2010, ミクロ/分子ルーレット 遊び方, ポートランド州立大学
ルーレット 遊び方概要
セルゲイ・オフチニコフは系統推論を使用する, タンパク質構造の予測/決定, タンパク質設計, ディープラーニング, エネルギーベースのモデル, 環境における進化の問題に取り組むための微分可能プログラミング, ルーレット 遊び方, ゲノム, 構造, そして分子スケール, タンパク質進化の統一モデルを開発することを目的.
最近の出版物
- 正確な デノボ 深層学習を使用した高親和性タンパク質結合大環状化合物の設計. レティ, SA, ユルゲンス, D, アデボミ, V, ブエソ, YF, 趙, Q, レヴェイユ, AN, リュー, A, ベラ, AK, ウィルムス, JA, ウフィング, A 他。 2024.bioRxiv、.
ドイ: 10.1101/2024.11.18.622547Pルーレット 遊び方D:39605685 - タンパク質言語モデルは相互作用する配列モチーフの進化統計を学習. 張, Z, ウェイメント・スティール, 香港, ブリクシ, G, ワン, H, カーン, D, オフチニコフ, S. 2024. Proc Natl Acad Sci USA 121, e2406285121.
ドイ: 10.1073/プナス.2406285121Pルーレット 遊び方D:39467119 - 緩和された配列空間での最適化を使用したスケーラブルなタンパク質設計. フランク, C, コショウエイ, A, フβ, L, シヴィエッツ, D, プッツ, D, ウェーバー, L, 趙, Z, 服部, M, フェン, S, デ・スティグテル, Y 他. 2024. 科学 386, 439-445.
ドイ: 10.1126/科学.adq1741Pルーレット 遊び方D:39446959 - ColabFold を使用した簡単かつ正確なタンパク質構造予測. キム, G, リー, S, レヴィ カリン, E, キム, H, 森脇, Y, オフチニコフ, S, シュタイネッガー, M, ミルディタ, M. 2024. ナット プロトック , .
ドイ: 10.1038/s41596-024-01060-5Pルーレット 遊び方D:39402428 - 可溶性および機能性膜タンパク質類似体のコンピューター設計. ゴベルデ, カナダ, パセサ, M, ゴールドバッハ, N, ドルンフェルド, LJ, バルビ, PEM, ジョージオン, S, ロセット, S, カプール, S, チョードリー, J, ダウパラ, J 他. 2024. 自然 631, 449-458.
ドイ: 10.1038/s41586-024-07601-yPルーレット 遊び方D:38898281 - 新たに設計された水溶性および膜貫通型の検証β-バレル by インシリコ 折りたたむ、溶かす。 エルモシラ, 午前, バーナー, C, オフチニコフ, S, ヴォロビエワ, AA. 2024. タンパク質科学 33, e5033.
ドイ: 10.1002/pro.5033Pルーレット 遊び方D:38864690 - ゲノム言語モデルはタンパク質の共制御と機能を予測する. ファン, Y, コーンマン, アル, ケロッグ, えっ, オフチニコフ, S, ギルギス, PR. 2024. ナットコミューン 15, 2880.
ドイ: 10.1038/s41467-024-46947-9Pルーレット 遊び方D:38570504 - 内在性膜タンパク質の可溶性機能類似体の計算機設計. ゴベルデ, カナダ, パセサ, M, ゴールドバッハ, N, ドルンフェルド, LJ, バルビ, PEM, ジョージオン, S, ロセット, S, カプール, S, チョードリー, J, ダウパラ, J 他。 2024.bioRxiv、.
ドイ: 10.1101/2023.05.09.540044Pルーレット 遊び方D:38496615 - 生命の領域にわたるタンパク質のホモオリゴマー化に関するアトラス. シュヴェケ, H, パセサ, M, レビン, T, ゴベルデ, カナダ, クマール, P, ドゥフー, Y, ドルンフェルド, LJ, デュブルイユ, B, ジョージオン, S, オフチニコフ, S 他. 2024. セル 187, 999-1010.e15.
ドイ: 10.1016/j.セル.2024.01.022Pルーレット 遊び方D:38325366 - 配列クラスタリングと AlphaFold2 による複数の立体構造の予測. ウェイメント・スティール, 香港, オジョアウォ, A, オッテン, R, アピッツ, JM, ピツウォン, W, ホンベルガー, M, オフチニコフ, S, コルウェル, L, カーン, D. 2024. 自然 625, 832-839.
ドイ: 10.1038/s41586-023-06832-9Pルーレット 遊び方D:37956700